Запросы в Яндексе в большинстве случаев не чувствительны к регистру, поэтому нет разницы. Однако, если Вы сомневаетесь проверьте через поиск один и тот же запрос изменив написание ключевого запроса, если ТОП меняется, то продвигать такие запросы лучше всего отдельно.
Вы можете вручную проверить выдачу с большой и маленькой буквы по одному и тому же ключевому слову. Пример выдачи при запросе с большой буквы:
Выдача с маленькой буквы:
Выдача с маленькой буквы:
